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無籽西瓜是三倍體，由于三倍體細胞在進行減數分裂時出現聯會紊亂的情況，所以三倍體西瓜不能形成種子。其親本是二倍體西瓜和四倍體。普通西瓜為二倍體植物，即體內有2組染色體(2N=22)，用秋水仙素處理其幼苗，令二倍體西瓜植株細胞染色體成為4倍體(4N=44)，這種4倍體西瓜能正常開花結果，種子能正常萌發成長。無籽西瓜是用種子種出來的，但這個種子不是無籽西瓜里的種子，而是自然的二倍體西瓜跟經過誘變產生的四倍體雜交后形成的三倍體西瓜里的種子。由于是三倍體，所以本身是沒有繁殖能力的，也沒有籽。無籽西瓜的培育，是培育出三倍體植株，使其發生聯會紊亂，從而無法產生西瓜籽。方法是先用秋水仙處理二倍體幼苗，使產生四倍植株，此為染色體變化，后用二倍體與四倍體雜交產生三倍體西瓜籽。正因為種子為三倍體，所以通過人工授粉產生多果實為無籽西瓜。所以無籽西瓜的培育原理是染色體畸變。

無籽西瓜嫁接育苗成活率低，愈合速度慢，是當前生產中普遍發生的問題，它制約了無籽西瓜生產的發展，并給瓜農造成較大的經濟損失。要提高無籽西瓜嫁接育苗成活率，培育健壯嫁接苗，就必須按照無籽西瓜的結構特性和生長特點來進行嫁接育苗。無籽西瓜育種通過以下幾步:二倍體秋水仙素加倍=>四倍體.四倍體西瓜與二倍體西瓜雜交得到的種子是三倍體西瓜,三倍體西瓜種下去不能產生種子,就是無籽西瓜，無籽番茄是在番茄開花未受粉就噴撒生長素得到的.

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